V velikih lokacijah Metro Exodus so zavetišča, kjer se lahko spočijete, in delovne mize, kjer lahko nadgradite svojo opremo in izdelate strelivo. Poglejmo, kje jih najdemo na lokacijah Volga, Kaspijsko morje in Tajga.
V zavetiščih lahko uporabite posteljo za zdravljenje Artyoma in spreminjanje časa dneva. Artyom lahko uporablja zavetišča za pobeg pred zasledovalci. Tukaj lahko tudi popravite svoje orožje, izdelate strelivo in naredite medicinske komplete.
Zavetišča so označena z ikonami hiš, delovne mize pa z ikonami orodij.