Ninja Gaiden Trilogy – Čeprav je to na zmogljivejši konzoli, igre včasih trpijo zaradi upočasnitve, neodzivnosti kontrol in izbirčnega zaznavanja zadetkov ter odsotnosti določenih glasbenih posnetkov med izrezki. Na nekaterih področjih je bila dodana tudi cenzura, vključno s spremembo barve Jaquiove krvi iz rdeče v zeleno. Del scenarija iz prve igre je bil spremenjen: Jaquiov stavek "Aaah! Zbudil se je" je nadomeščen z "Prekleto, buden je", kot tudi več novih tipkarskih napak, ki jih v različici NES ni bilo mogoče najti.